La genialità del Dottore e il suo amore viscerale per la tecnologia lo spingevano a "smanettare" costantemente con qualsiasi oggetto gli capitasse a tiro. Era capace di assemblare dispositivi stravaganti per affrontare le minacce più disparate: l'esempio più celebre rimane l'Analogo del Flusso Temporale, costruito usando nient'altro che una bottiglia di vino, delle forchette, un cavatappi, una macchina del caffè, un mazzo di chiavi, inchiostro e una tazza di tè. Questo bizzarro congegno fu fondamentale per sabotare il tentativo del Maestro di utilizzare la macchina TOMTIT ("The Time Monster"). Oltre alle sue invenzioni estemporanee, il Dottore dimostrò di saper ricorrere a misure estreme quando necessario. In un'occasione particolare, si vide costretto a utilizzare una bomba a orologeria — un'arma talmente pericolosa da essere bandita da quasi tutte le civiltà galattiche — pur di fermare il potentissimo Xhinn ("Amorality Tale"), non vedendo altre vie d'uscita.

Raramente lo si vedeva senza il suo fidato cacciavite sonico, lo strumento indispensabile per tirarlo fuori da ogni guaio. A questa incarnazione è legata anche la celebre frase: "Invertire la polarità del flusso di neutroni", diventata un vero marchio di fabbrica (nonostante, ironicamente, l'abbia pronunciata per intero solo in pochissime occasioni). Ma il Dottore non era solo scienza: mostrava anche una certa predilezione per i trucchi da prestigiatore e l'ipnosi. Lo abbiamo visto far apparire un mazzo di fiori dal nulla ("The Three Doctors") o ipnotizzare un membro di una banda irlandese per convincerlo a desistere dai suoi intenti ("Amorality Tale"). Questi talenti, uniti alla sua autorità naturale, lo rendevano un avversario imprevedibile e affascinante.

In questa incarnazione, il Dottore manifesta una personalità duale: è autoritario e ribelle allo stesso tempo. Spesso pretende il massimo da chi lo circonda, dimostrando un carisma tale da convincere persino le versioni di un universo parallelo dei suoi colleghi ad aiutarlo. Nonostante la consapevolezza della loro imminente fine, li sprona a salvare il "suo" mondo dalla minaccia che ha già condannato il loro ("Inferno"). Eppure, questa fermezza non soffoca mai la sua naturale compassione. Il Dottore si sforza sempre di comprendere il punto di vista altrui, arrivando a concedere persino ai suoi vecchi nemici, gli Ice Warriors, il beneficio del dubbio: sul pianeta Peladon, offre loro la possibilità di dimostrare la propria innocenza durante un'indagine per omicidio, accantonando i trascorsi bellicosi ("The Curse of Peladon").

Il suo lato empatico emerge chiaramente nel sostegno verso gli altri, come quando rassicura un soldato Thal spiegandogli che il vero coraggio non consiste nell'assenza di paura, ma nel provarla e agire nonostante essa ("Planet of the Daleks"). Tuttavia, se provocato, il Dottore può scivolare in una rabbia fredda e tagliente. Non esitò a rischiare la vita per rinfacciare la propria codardia al governatore di una Terra alternativa collaborazionista dei Dalek ("Day of the Daleks"). Questa indignazione colpisce duramente anche chi mostra una mente chiusa o egocentrica: memorabile fu il suo scontro verbale con un inquisitore terrestre, che accusò di avere "la mente più chiusa mai incontrata" poiché accecato dall'odio per i Draconiani, ignorando le prove che dietro il conflitto ci fosse la regia dei Dalek ("Frontier in Space").

Il dovere verso il corretto fluire della storia può, a volte, prevalere sulla pietà personale. Incontrando il famigerato Rasputin ("The Wages of Sin"), il Dottore scopre che l'uomo non è il mostro descritto dai libri di storia; ciò nonostante, è costretto a lasciarlo morire per preservare la linea temporale.

Tuttavia, il Terzo Dottore sa anche essere un pragmatico disposto a piegare le regole di fronte a minacce esistenziali: pur di impedire ai Sild di rapire il Maestro per i propri oscuri scopi, arriva all'estremo paradosso di distruggere la stessa astronave due volte in momenti diversi ("Harvest of Time").

Nonostante la sua apparenza autoritaria, il benessere di chi gli stava accanto era la sua costante preoccupazione. Il legame con le sue compagne era così profondo da condizionare le sue scelte tattiche: in un’occasione, esitò a distruggere il TARDIS del Maestro per spezzare il suo controllo sul potente Chronovore Kronos, poiché quell'azione avrebbe ucciso anche Jo Grant, in quel momento prigioniera all'interno della nave ("The Time Monster"). Come per i suoi predecessori, ogni vita era sacra, ma questa incarnazione mostrava una spiccata propensione a rischiare la propria pelle in prima persona, agendo con la stessa determinazione che pretendeva dagli altri.

Il desiderio del Dottore di ispirare gli altri entrava talvolta in conflitto con il suo ingombrante ego. La sua prima assistente alla UNIT, la brillante scienziata Liz Shaw, scelse infine di andarsene perché si sentiva superflua di fronte all'intelletto straripante del Dottore. Quest'ultimo, pur accettando la sua decisione, espresse un sincero rammarico per non aver trascorso con lei abbastanza tempo al di fuori degli impegni lavorativi ("The Scales of Injustice").

L'inizio con la sostituta di Liz, Jo Grant, non fu dei più semplici. Il Dottore desiderava un assistente più qualificato, mentre il Brigadiere sosteneva ironicamente che tutto ciò di cui il Dottore avesse bisogno fosse qualcuno che gli passasse gli attrezzi e gli ricordasse costantemente quanto fosse geniale ("Terror of the Autons").

Nonostante i dubbi iniziali, i due svilupparono un legame profondissimo. Jo divenne per lui quasi come una figlia: insieme affrontarono il Maestro, i Dalek e i Chronovores, mentre il Dottore si impegnava con pazienza a istruirla sui segreti della scienza e dell'universo. Il suo dolore fu genuino e palpabile quando Jo decise infine di lasciarlo per sposarsi e iniziare una nuova vita, segnando uno dei momenti più malinconici del suo esilio.