Gli scritti di Cotton includevano spesso elementi della mitologia greca, e quindi suggerì la Guerra di Troia come ambientazione adatta per una storia di Doctor Who. Sebbene probabilmente basata su eventi reali ormai perduti, una narrazione romanzata della Guerra si sviluppò attraverso la sua rivisitazione in varie forme classiche, la più famosa delle quali è l'Iliade di Omero. Qui la Guerra fu innescata dal rapimento di Elena, moglie del re Menelao di Sparta, da parte di Paride, principe di Troia. Menelao e suo fratello, re Agamennone di Micene, forgiarono un'alleanza di forze greche per assediare Troia; tra coloro che combatterono al loro fianco c'erano il re Odisseo di Itaca e l'eroe Achille. La Guerra di Troia durò dieci anni, culminando nella completa distruzione di Troia e nella morte della maggior parte dei suoi cittadini.

Un elemento significativo della mitologica Guerra di Troia, che probabilmente non aveva alcun fondamento nella realtà, era il Cavallo di Troia; potrebbe essere stato ispirato dalle prime macchine d'assedio, che furono sviluppate per la prima volta in quel periodo. Pertanto, Cotton decise di fare dell'insistenza del Dottore sul fatto che il Cavallo non venisse menzionato nella trama, per paura di cambiare la storia. Un'altra invenzione dell'Iliade fu Paride, che traeva origine da precedenti leggende greche. Dopo aver inizialmente pianificato di includerlo nell'avventura, Cotton omise Paride durante le rifiniture della trama, per poi reintrodurlo dopo che i primi due episodi furono commissionati con il titolo "The Mythmakers" il 13 maggio.

Un'ulteriore fonte di ispirazione durante lo sviluppo di "The Mythmakers" fu la storia di Troilo e Cressida. Varianti di questa storia d'amore iniziarono ad apparire già nel XII secolo, e in seguito divenne famosa nelle opere di Boccaccio, Chaucer e Shakespeare. Nella leggenda, il principe troiano Troilo si innamorò di Cressida, una giovane sacerdotessa. Cressida alla fine lasciò Troilo per il guerriero greco Diomede, causando la morte di Troilo durante l'assedio di Troia. Cotton immaginò che Vicki assumesse il nome di Cressida e si legasse sentimentalmente a Troilo, per poi abbandonarlo alla fine della storia con Diomede, le sembianze assunte da Steven. Cotton fece anche ampio uso di altri miti greci nei suoi dialoghi e nei nomi dei suoi personaggi. La spia Ciclope, ad esempio, prese il nome dai leggendari giganti monocoli che sarebbero apparsi più notoriamente nell'Odissea, il seguito dell'Iliade di Omero . A un certo punto, Cotton immaginò anche dei ruoli per la moglie di Priamo, Ecuba, e per la moglie di Ettore, Andromaca, sebbene nessuna delle due sarebbe apparsa nelle sceneggiature definitive.

L'azione degli episodi conclusivi si è evoluta considerevolmente con lo sviluppo di "The Mythmakers" da parte di Cotton. Inizialmente, intendeva concludere gli elementi troiani della narrazione entro la fine del secondo episodio, con la seconda metà della serie incentrata sul viaggio di ritorno dei Greci. Una volta deciso di concentrarsi esclusivamente sull'assedio di Troia, il quarto episodio vede Steven e Vicki liberati da Priamo dopo che il cavallo è stato portato in città. Usarono il codice Morse per contattare il Dottore. Quando i Greci fuoriescono dal cavallo, il Dottore e Steven reclamano il TARDIS, ma Vicki torna a palazzo per recuperare un ricordo datole da Elena. Lì assistette a Priamo che quasi sconfigge Achille in battaglia, solo per essere ucciso da Odisseo. L'elemento di Steven ferito fu aggiunto su richiesta di Terry Nation, che progettava di sfruttare lo sviluppo nel primo episodio della serie successiva, The Daleks' Master Plan.

Quando il terzo e il quarto episodio furono commissionati l'11 giugno, il titolo della storia era stato modificato in "The Myth-Makers". Successivamente fu nuovamente modificato in " The Myth Makers". (Il nome "The Trojans" apparve anche in alcuni documenti, e "The Trojan War" è stato suggerito come altro titolo provvisorio.) La BBC si oppose al gioco di parole che Cotton aveva ideato per i titoli dei suoi episodi; solo il nome originale del secondo episodio - Small Prophet, Quick Return - sopravvisse, su insistenza di Tosh.

The Myth Makers avrebbe dovuto essere la prima serie realizzata come parte del terzo blocco di produzione di Doctor Who, sebbene Galaxy 4 e Mission To The Unknown fossero stati esclusi dal secondo blocco per dare inizio alla stagione televisiva. Durante la realizzazione di Galaxy 4 a luglio, John Wiles non era stato contento di sentire Maureen O'Brien lamentarsi dei suoi dialoghi. Decise che Vicki sarebbe stata eliminata in The Myth Makers, il che coincise con la scadenza del contratto di O'Brien. La trama di Cotton fu quindi modificata per far sì che Vicki rimanesse con Troilo e lo aiutasse a sfuggire all'assedio di Troia, nonostante ciò contraddicesse il mito tradizionale.

Per sostituire Vicki, Wiles e Tosh concepirono una nuova compagna che sarebbe stata introdotta nell'episodio finale di The Myth Makers: l'ancella troiana, Katarina. Tuttavia, divenne presto chiaro che il personaggio sarebbe stato praticamente inutilizzabile su base continuativa; poiché proveniva da un periodo così remoto della storia della Terra, avrebbe costantemente avuto bisogno di spiegazioni anche sulle cose più semplici nelle storie successive. Di conseguenza, Wiles e Tosh decisero di uccidere Katarina a metà del The Daleks' Master Plan.

Il candidato iniziale preso in considerazione per dirigere The Myth Makers era Derek Martinus, che finì per essere chiamato a lavorare con urgenza a Galaxy 4 e Mission To The Unknown. Al suo posto, fu chiamato Michael Leeston-Smith, il cui primo compito furono le riprese nelle pianure intorno a Troia, a Frensham Little Pond a Frensham, nel Surrey. Si trattò delle riprese in esterni più estese di Doctor Who in oltre un anno: i lavori iniziarono il 27 agosto e proseguirono dal 30 agosto al 2 settembre. Sia Cavan Kendall (che interpreta Achille) che James Lynn (Troilo) riportarono lievi ferite durante le scene di combattimento, costringendo a diverse riprese a cavallo. Poco dopo la conclusione delle riprese in esterni, Leeston-Smith trascorse una giornata (probabilmente il 3 settembre) a girare foto di modelle all'Ham Polo Club di Ham, nel Middlesex.

Nel frattempo, il cast regolare era tornato dal mese di pausa, ignaro del fatto che fosse in corso un cambio di cast. Il 30 luglio, a Maureen O'Brien era stato proposto un contratto rivisto, che includeva un'opzione della BBC per venti episodi oltre a The Myth Makers; non aveva mai preso in considerazione la possibilità che questo non venisse accettato. L'attrice rimase quindi scioccata quando, il 3 settembre, le fu comunicato che The Myth Makers sarebbe stato il suo canto del cigno in Doctor Who. Nonostante la sorpresa, O'Brien non era del tutto scontenta della situazione, poiché era ormai insoddisfatta del ruolo di Vicki. Lo stesso giorno, il contratto di Peter Purves fu esteso. Il 9 settembre, Adrienne Hill fu scelta per il ruolo di Katarina. Questa decisione fu presa da Douglas Camfield, il regista di The Daleks' Master Plan. Ironicamente, il primo lavoro di Hill in Doctor Who sarebbe stato girare la scena della sua morte per quella storia.

Il brusco licenziamento di O'Brien incrinò ulteriormente il rapporto tra William Hartnell e John Wiles. Hartnell era già a disagio con l'approccio di Wiles a Doctor Who e gli mancava la presenza di Verity Lambert; The Myth Makers sarebbe stata la prima serie di cui Wiles sarebbe stato accreditato come produttore. A peggiorare le cose, la salute di Hartnell era in declino, con l'arteriosclerosi che gli impediva sempre più di ricordare le battute. La star della serie era anche insoddisfatta di quello che riteneva un ruolo sminuito per il Dottore nelle sceneggiature di Cotton. Hartnell temeva di essere messo in ombra da guest star di spicco, tra cui Francis de Wolff (Agamennone) e soprattutto Max Adrian (Priamo). Adrian era ebreo e omosessuale, due caratteristiche che Hartnell non tollerava.

I Myth Makers videro Doctor Who tornare alla sua sede abituale, il Riverside Studio 1 a Hammersmith, Londra; ogni episodio fu registrato di venerdì consecutivi, a partire dal 17 settembre. Durante le prove per la prima puntata, Temple Of Secrets, Hartnell si fece male dopo essere stato colpito alla spalla da una piattaforma, nonostante avesse resistito fino alla fine. La settimana successiva, la star della serie fu colpita dal lutto per la morte della zia Bessie, l'unico membro della famiglia a cui era stato vicino durante la sua giovinezza travagliata. Purtroppo, le sue responsabilità nei confronti dei Myth Makers gli impedirono di partecipare al suo funerale. Hartnell subì un altro infortunio durante il lavoro al Riverside, a seguito di una lite in un pub vicino durante l'ora di pranzo; un occhio nero dovette essere frettolosamente nascosto sotto il trucco. Nel frattempo, Adrienne Hill apparve in studio per la prima volta l'8 ottobre, quando fu registrato Horse Of Destruction. Quello fu anche l'ultimo giorno di Maureen O'Brien in Doctor Who.

Fino a quel momento, gli episodi di Doctor Who avevano raramente subito un montaggio sostanziale in post-produzione, ma Horse Of Destruction era un'eccezione. Ci furono diversi tagli, uno dei più significativi dei quali riguardava una scena importante che coinvolgeva Hill. Si trattava di uno scambio di battute tra Vicki e Katarina, in cui la ragazza troiana raccontava di come fosse diventata una serva. Nel frattempo, Katarina rivelò che recenti presagi avevano predetto la sua imminente fine...