Il regista assegnato a "Il nemico del mondo" fu Barry Letts. Questo sarebbe stato il suo primo lavoro su Doctor Who, sebbene avesse presentato delle idee per la storia che erano state rifiutate dall'ex story editor Gerry Davis alla fine del 1966. Letts lavorò a stretto contatto con l'assistente story editor Derrick Sherwin su "Il nemico del mondo", poiché le sceneggiature erano generalmente brevi e si riteneva che contenessero troppi dialoghi e troppo poca azione. In particolare, fu Letts a suggerire la sequenza di inseguimento iniziale con un elicottero e un hovercraft, in sostituzione di scene logisticamente difficili ambientate in un affollato resort. I nomi di due membri dell'equipaggio dell'hovercraft furono cambiati da Tibor e Otto a Rod e Curly, rispettivamente, il che potrebbe suggerire che l'ambientazione fosse originariamente un luogo dell'Europa orientale, piuttosto che l'Australia.

Per il ruolo di Astrid, Letts scelse l'attrice sudafricana Mary Peach, che aveva recitato in Inside Story e, più recentemente, ne I tre moschettieri. Poco prima dell'inizio delle riprese, Letts venne informato che Peach si sarebbe tirata indietro, essendosi rammaricata che il suo personaggio fosse di fatto scomparso dalla narrazione dopo il quarto episodio. Letts era ansioso di mantenere Peach in Doctor Who e accettò di ristrutturare gli ultimi due episodi per dare maggiore risalto ad Astrid. Più o meno nello stesso periodo, il 25 ottobre, il contratto di Frazer Hines per interpretare Jamie fu esteso per includere Il nemico del mondo.

Il 5 novembre, la produzione iniziò con quattro giorni a Climping Beach, nel West Sussex, che fungeva da spiaggia dove si materializzò il TARDIS. Anche la scena del quinto episodio, in cui Astrid viene inseguita attraverso un campo da una guardia, fu girata lì. Il 9 novembre, cast e troupe si trasferirono a Ealing, Londra, dove l'esterno di Villiers House fu utilizzato come ufficio di Giles Kent, e Walpole Park fu il luogo dell'incontro segreto tra Jamie, Victoria e Astrid. Le riprese presso i BBC Television Film Studios di Ealing si svolsero poi il 10, 11 e 13 novembre. Il giorno centrale fu utilizzato per le riprese dei modelli; per il resto, la preoccupazione principale era la scena culminante del TARDIS, l'unica a mostrare il Dottore e Salamander insieme. Sfortunatamente, Letts non era informato sul modo migliore per registrare queste sequenze e l'errore fu aggravato da un problema all'attrezzatura. Ciò limitò gravemente il numero di riprese che Letts avrebbe potuto utilizzare nel programma finito.

Come di consueto, ogni episodio di The Enemy Of The World fu registrato in sabati consecutivi presso lo Studio D di Lime Grove a Shepherd's Bush, Londra. Il primo episodio andò in onda il 2 dicembre e segnò il primo utilizzo di un nastro video ad alta definizione a 625 linee in Doctor Who, in contrapposizione al vecchio standard a 405 linee. Nelle due settimane successive, il cugino di Frazer Hines, Ian Hines, si unì al cast come guardia. Né Jamie né Victoria apparvero nel quarto episodio, quindi sia Frazer Hines che Deborah Watling erano assenti dallo studio il 23 dicembre. Quel giorno, il nipote di Letts, Andrew Staines, sostituì all'ultimo minuto un altro attore nel ruolo del sergente di Benik. Nelle due settimane successive, fu il turno di Troughton di vedere un membro della famiglia interpretare una delle guardie, poiché suo figlio David fece la sua prima apparizione in Doctor Who. Le registrazioni per la serie si conclusero il 6 gennaio 1968.

All'inizio del nuovo anno, il palinsesto del sabato della BBC ha subito una modifica. Per diverse settimane, Doctor Who era stato seguito da un notiziario, dal talk show Dee Time e poi dalla sitcom musicale The Monkees. Dal 13 gennaio, giorno in cui è andato in onda il quarto episodio di The Enemy Of The World, Dee Time e The Monkees sono stati scambiati.

"The Enemy Of The World" fu il fulcro di una serie di cambiamenti nei ruoli chiave della produzione di Doctor Who. In particolare, questa sarebbe stata l'ultima storia supervisionata dal produttore Innes Lloyd, che aveva desiderato lasciare Doctor Who per diversi mesi. Come pianificato da tempo, lo story editor Peter Bryant fu designato come successore di Lloyd. Fu concordato che Derrick Sherwin avrebbe assunto il ruolo di story editor, il che significava che sarebbe stato necessario reclutare anche un nuovo assistente. Sherwin stesso aveva intenzione di rimanere in Doctor Who solo per un breve periodo, quindi il suo intento era quello di assumere qualcuno che potesse rapidamente addestrare come suo sostituto. Offrì quindi l'incarico al suo amico Terrance Dicks, che si unì al team di produzione all'inizio del 1968.

Fu più o meno in questo periodo che Troughton accettò di tornare in Doctor Who per una terza stagione. Allo stesso tempo, tuttavia, confessò a Letts di essere stanco del ritmo estenuante della produzione del programma. Troughton detestava in particolare il fatto che lui, Hines e Watling fossero spesso costretti a girare inserti per una serie nei loro giorni liberi, o nel bel mezzo delle prove in studio per un'altra storia. Letts osservò che Doctor Who avrebbe dovuto essere ridotto a ventisei episodi all'anno – rispetto ai quarantasei episodi che comporrebbero l'attuale blocco di registrazione – poiché ciò avrebbe consentito una settimana di pausa tra le serie per occuparsi di questioni come la pre-ripresa. Troughton fu entusiasta dell'idea e la suggerì a Bryant, che cercò di implementarla per il sesto blocco di produzione, che sarebbe iniziato a fine estate.

Oltre alla partenza di Lloyd, "The Enemy Of The World" fu anche l'ultima storia supervisionata dal responsabile della divisione drammaturgica della BBC, Sydney Newman, l'uomo che aveva guidato lo sviluppo di Doctor Who nel 1963. Terminato il suo contratto, Newman lasciò la BBC per lavorare per l'Associated British Picture Corporation. Tuttavia, i suoi nuovi datori di lavoro furono presto acquisiti, il che spinse Newman a tornare nel suo Canada. Lì lavorò come consulente per vari enti dell'industria cinematografica e televisiva e fu il commissario capo del National Film Board of Canada. Newman tornò infine in Inghilterra; nel 1986, incontrò la BBC per discutere del rinnovamento di Doctor Who, anche se non ne seguì nulla. Ritiratosi in Canada, Newman morì di infarto a Toronto, Ontario, il 30 ottobre 1997.

Questa storia vede Patrick Troughton in una doppia interpretazione sia nei panni del Dottore che del malvagio Salamander.

Proprio come la storia del Primo Dottore del 1966 " Il massacro della vigilia di San Bartolomeo ", "Il nemico del mondo" è stata influenzata dal desiderio dell'attore protagonista di interpretare ruoli diversi dal Dottore. Inizialmente, era previsto che i due personaggi di Patrick Troughton si incontrassero più di una volta, ma a causa della complessità tecnica, è stata registrata solo la scena del confronto. Questo è avvenuto al culmine della storia (utilizzando il montaggio e una tecnica a schermo diviso).

In questa storia appare anche il figlio di Patrick Troughton, David (che sarebbe poi apparso in " The War Games ", nella storia del Terzo Dottore del 1972 " La maledizione di Peladon " e nella storia del Decimo Dottore del 2008 " Midnight "). Appare anche il cugino di Frazer Hines, Ian. Entrambi hanno interpretato il ruolo di guardie: Ian negli episodi tre e quattro, e David negli episodi cinque e sei.

Né Deborah Watling (che interpreta Victoria Waterfield ) né Frazer Hines (che interpreta Jamie McCrimmon ) compaiono nell'episodio quattro, poiché erano in vacanza durante la settimana in cui è stato registrato questo episodio.

La produzione di questa storia ha incluso l'uso di materiale filmato per il film di James Bond del 1963 "Dalla Russia con amore" per mostrare l'elicottero che esplode.

Insolitamente, l'episodio tre inizia senza una ripresa dell'episodio precedente. L'episodio tre, registrato il 16 dicembre 1967, ha anche segnato il primo utilizzo di un nastro video a 625 linee in Doctor Who, in contrapposizione al vecchio standard a 405 linee. Questo era in preparazione, da parte della BBC, per le trasmissioni a colori.

Si sente il Dottore dire che sono stati " sul ghiaccio " (probabilmente riferendosi alla storia precedente " I guerrieri del ghiaccio "), per spiegare perché non sono informati sull'attuale situazione politica. Un altro racconto precedente, " Gli abominevoli uomini delle nevi ", viene citato anche nella scena in cui Giles Kent menziona un " molo in disuso " e si sente il Dottore rispondere con " Uno Yeti in disuso ? " .

Al momento di questa storia, la posizione di assistente story editor era ricoperta da Terrance Dicks. Ciò era dovuto all'imminente promozione dello script editor Peter Bryant.

Questa fu l'ultima storia ad essere prodotta sotto l'egida del creatore di Doctor Who, Sydney Newman, che lasciò il suo incarico di responsabile della sezione Drama della BBC alla fine del 1967.

Per diversi anni, l'unico episodio di questa storia a sopravvivere all'eliminazione fu il terzo. Anche il quarto episodio fu uno dei pochi episodi mancanti di Doctor Who per i quali non si sa che siano state scattate Telesnap (fotografie fuori campo). Il motivo non è noto.

Tutti e sei gli episodi furono poi scoperti, insieme a cinque episodi di " The Web of Fear ", in una stazione televisiva nella città nigeriana di Jos nel 2013, completando così questa storia in sei parti. Questa scoperta significa che questa storia è diventata la seconda storia di Patrick Troughton, delle sue prime due stagioni, ad essere completamente restaurata per la BBC.