Il legame tra il Brigadiere e il Dottore si è consolidato definitivamente durante la crisi raccontata in "The Invasion". In quell'occasione, Lethbridge-Stewart coinvolse immediatamente il Dottore per contrastare il piano dei Cybermen di conquistare il pianeta, e proprio la riuscita di quella missione trasformò il loro rapporto professionale in una solida amicizia.

Un momento particolarmente critico nel rapporto con il Dottore si verificò durante il primo incontro con i Siluriani. Nonostante il Dottore fosse convinto che la razza umana e quella dei rettili potessero convivere pacificamente, il Brigadiere scelse la soluzione militare e ordinò la distruzione della loro base sotterranea. Questa decisione causò una profonda ferita nel legame tra i due amici, mettendo in luce l'inconciliabile differenza tra l'idealismo dell'alieno e il pragmatismo del soldato incaricato di proteggere la propria specie a ogni costo.

Il peso delle sue responsabilità e la natura segreta della UNIT ebbero purtroppo conseguenze devastanti anche nella sua vita privata. Il matrimonio del Brigadiere con la moglie Fiona andò in frantumi proprio perché lui non poteva rivelarle la verità sulla natura del suo lavoro. Il divorzio divenne inevitabile durante i drammatici eventi narrati in "The Scales of Injustice", mentre il Dottore tentava ancora una volta un contatto pacifico con un nuovo gruppo di Siluriani. I due non riuscirono mai a riconciliarsi, ma il Brigadiere trovò una forma di riscatto personale anni dopo, quando riuscì a ricostruire il rapporto con sua figlia Kate. Fu durante gli eventi di "Downtime" che scoprì con commozione che lei aveva scelto di chiamare suo figlio Alistair, proprio come lui, onorando così il suo nome.

Inizialmente, il Brigadiere si rifiutò di credere alla rigenerazione multipla, pensando che il Dottore avesse semplicemente armeggiato con il TARDIS provocando un involontario ritorno del proprio corpo alla forma precedente. Nonostante il sergente Benton sostenesse la versione dell'alieno, il Brigadiere mantenne il suo scetticismo finché non vide con i propri occhi il Secondo e il Terzo Dottore discutere insieme. Dopo aver assistito persino all'apparizione del Primo Dottore, commentò ironicamente di non essersi reso conto di quanto fosse fortunato prima di allora, riflettendo mestamente, dopo la partenza delle versioni passate, che un solo Dottore era già più che sufficiente per i suoi poveri nervi.

Sebbene la sconfitta di Omega avesse segnato la fine dell'esilio del Dottore, quest'ultimo scelse di proseguire la collaborazione con la UNIT per tutto il resto della sua terza incarnazione. Il sodalizio giunse a un momento di profonda solennità dopo la fatale battaglia contro i Ragni Giganti di Metebelis III. Il Brigadiere si ritrovò ancora una volta testimone del mistero del cambiamento, assistendo alla trasformazione fisica dell'amico davanti ai suoi occhi. In quel momento, con la rassegnazione di chi ha ormai visto l'impossibile diventare routine, mormorò un semplice e iconico commento: "Eccoci di nuovo!".

Sotto questa facciata rigorosa e tradizionale, tuttavia, si celava una mente straordinariamente acuta e flessibile. Questa caratteristica si rivelò la sua più grande fortuna, poiché gli permise di sopravvivere e di eccellere in un mondo che era cambiato radicalmente dopo i suoi primi incontri con le specie aliene. Mentre altri ufficiali avrebbero potuto cedere all'incredulità o al panico di fronte a invasioni di Yeti o Cybermen, il Brigadiere riuscì sempre a mantenere il controllo, adattando le tattiche militari a minacce che andavano oltre ogni comprensione umana.

La sua stretta associazione con il Dottore fu il vero banco di prova per questa flessibilità mentale. Nonostante le sue radici conservatrici, Alistair fu capace di accettare l'impossibile, viaggiando in altre dimensioni e collaborando con un alieno millenario che cambiava volto e personalità. Fu proprio questa capacità di unire il rigore del vecchio mondo militare alla comprensione del nuovo universo fantascientifico a renderlo l'unico uomo in grado di guidare la UNIT attraverso i decenni, diventando un punto di riferimento insostituibile per la protezione della Terra.

Nonostante il modo di fare brusco e la voce secca che potevano incutere timore, Lethbridge-Stewart possedeva un'integrità morale rarissima: non avrebbe mai chiesto a un soldato o a un ufficiale sotto il suo comando di affrontare un pericolo che lui stesso non fosse disposto a sfidare in prima persona. Questa nobiltà d'animo lo portava a gettarsi costantemente nel cuore della battaglia; come ebbe modo di sottolineare ironicamente in "Terror of the Autons", non si sentiva affatto un burocrate "legato alla scrivania". Era un uomo d'azione che preferiva il campo di battaglia alla sicurezza di un ufficio.

Questa determinazione lo rendeva disposto a compiere qualunque scelta necessaria per la sicurezza della Terra, anche sapendo che il Dottore avrebbe condannato fermamente le sue azioni. Il caso dei Siluriani rimane l'esempio più emblematico di questa frattura ideologica: laddove il Dottore vedeva una possibilità di dialogo, il Brigadiere vedeva una minaccia da eradicare. Non a caso, proprio in "Terror of the Autons", il Dottore gli rivolse una delle sue frecciate più famose, commentando sarcasticamente che, a volte, l'espressione "Intelligenza Militare" gli sembrava una vera e propria contraddizione in termini.

Quando l'esilio del Dottore terminò, il Brigadiere dovette abituarsi all'idea che il Signore del Tempo riprendesse i suoi viaggi nel TARDIS con frequenza sempre maggiore. Tuttavia, mantenne sempre la ferma certezza che, in caso di una vera emergenza planetaria, il Dottore sarebbe tornato al suo fianco. Anche se dopo la rigenerazione nella quarta incarnazione le visite regolari alla sede della UNIT cessarono, l'amicizia tra i due rimase intatta attraverso i decenni e i numerosi cambi di aspetto e personalità del Dottore.

Per il Dottore, il Brigadiere è rimasto per sempre "il miglior soldato che avesse mai conosciuto", un uomo di rara integrità e coraggio. Dal canto suo, la UNIT ha continuato a considerare Lethbridge-Stewart come una risorsa insostituibile, richiamandolo spesso in servizio attivo ogni volta che le circostanze richiedevano la sua esperienza unica e la sua capacità di gestire l'impossibile.

Tuttavia, il suo ruolo internazionale lo tenne lontano da alcuni scontri televisivi successivi, costringendo il Dottore a collaborare con altri ufficiali. In questo lasso di tempo, la cronologia dei loro incontri si fece complessa: il Brigadiere incrociò la strada del Nono Dottore quando l'organizzazione Albion Defence tentò di screditare e sostituire la UNIT. In quell'occasione, la collaborazione tra il vecchio soldato e l'incarnazione futura del Dottore fu essenziale per smascherare i crimini della Albion e riabilitare il nome della Task Force, grazie anche al supporto dell'infermiera Tara Misha.

Un capitolo straordinario della sua vita si aprì quando i Vardan e il Monaco Ficcanaso tentarono di soggiogare la Terra manipolando la UNIT attraverso l'ipnosi subliminale inserita in simulatori di realtà virtuale. In questa circostanza, il Brigadiere dimostrò una forza mentale inaspettata: ispirato dall'esempio del Dottore, si era convertito al Buddhismo e, grazie alla pratica della meditazione, lui e il sergente Benton risultarono immuni ai condizionamenti del Monaco. Sebbene lo scontro rischiò di costargli la vita, l'intervento di Ace e di un Chronovore permise di riscrivere la storia e salvarlo.

Comprendendo però che il mondo stava cambiando e che un soldato della tempra e dell'onore di Alistair non avrebbe trovato posto nelle oscure trame politiche del decennio a venire, il Dottore compì un atto di estrema protezione. Per il bene del suo caro amico, lo ipnotizzò affinché scegliesse il ritiro dalla UNIT e gli fece dimenticare quest'ultima, traumatica avventura, permettendogli di trovare finalmente una meritata serenità lontano dal campo di battaglia.

La causa di questo vuoto mentale risiedeva in un paradosso temporale: sulla nave di Mawdryn, il Brigadiere del 1977 era entrato in contatto fisico con la sua versione futura del 1983. Il cortocircuito temporale risultante aveva cancellato i suoi ricordi, che rimasero sepolti fino a quando il Quinto Dottore non riuscì a risolvere la situazione, permettendo al Brigadiere di riappropriarsi del suo passato proprio nel periodo in cui era stato invitato a un ricevimento annuale della UNIT ("Mawdryn Undead").

Poco dopo aver recuperato la memoria, il Brigadiere fu trascinato in un'altra avventura monumentale. Dopo una visita inaspettata del Secondo Dottore, i due furono teletrasportati nella Zona della Morte su Gallifrey, il pianeta natale dei Signori del Tempo. In quel luogo desolato, il Brigadiere dimostrò ancora una volta il suo valore: collaborò con diverse incarnazioni del Dottore per sventare i piani di Borusa, un Signore del Tempo corrotto dalla brama di immortalità.

In questo scenario surreale, circondato da vecchi amici come il Maestro e vari ex-compagni di viaggio, il Brigadiere diede prova di una straordinaria resilienza psicologica. Ormai rassegnato e persino divertito dalle assurdità della vita del Dottore, accettò con naturalezza la presenza simultanea di più versioni del suo amico, definendoli con affetto «Splendidi ragazzi... tutti voi». Il suo contributo fu decisivo nella Torre di Rassilon, dove aiutò i Dottori a cogliere di sorpresa il Maestro durante lo scontro finale, confermandosi come l'unico umano capace di mantenere il sangue freddo anche di fronte alla cosmologia dei Signori del Tempo ("The Five Doctors").

Anche lontano dal servizio attivo, il Brigadiere non smise mai di indagare sulle minacce silenziose. Mentre cercava di fare luce sulle attività sospette della compagnia SeneNet, finì nuovamente prigioniero. L'azienda si rivelò essere una copertura per un nuovo tentativo di invasione da parte della Coscienza Nestene. In questo frangente, Alistair fu soccorso dal Sesto Dottore e dalla sua compagna Melanie Bush. L'episodio dimostrò quanto profondo fosse il rispetto che il Brigadiere ispirava: uno degli scagnozzi dei Nestene, riconoscendo in lui il suo antico comandante, decise di ribellarsi ai propri datori di lavoro proprio in virtù del passato trascorso come soldato della UNIT sotto i suoi ordini ("Business Unusual").

In quello che sembrò essere il suo atto finale di eroismo, il Brigadiere decise di affrontare da solo il Distruttore, un demone colossale evocato da Morgaine. Sapendo che il Dottore, per via della sua natura, avrebbe esitato a uccidere la creatura, il Brigadiere prese l'iniziativa e, armato di proiettili d'argento, sparò al mostro a bruciapelo. Nonostante la devastante esplosione che ne seguì, Alistair riuscì miracolosamente a sopravvivere, dimostrando che neanche le forze del caos potevano abbattere facilmente il vecchio soldato ("Battlefield").

Questo evento segnò il suo rientro ufficiale nella UNIT con il ruolo di consigliere speciale. In questa veste, la sua esperienza si rivelò fondamentale per l'Ottavo Dottore e Bernice Summerfield durante un'invasione di Guerrieri del Ghiaccio che minacciava la Gran Bretagna ("The Dying Days"). Poco prima della fine del millennio, nel 1999, il Brigadiere incrociò nuovamente la strada del Quinto Dottore per indagare su una serie di attentati terroristici a Los Angeles. L'indagine rivelò un complotto ancora più vasto: due razze aliene in guerra stavano usando la Terra come campo di battaglia, e solo l'unione tra la saggezza tattica di Lethbridge-Stewart e l'ingegno del Dottore riuscì a evitare il disastro ("The King of Terror").

Poco tempo dopo, Lethbridge-Stewart diede prova della sua costante vigilanza individuando prove di creature invisibili simili a folletti. Contattò nuovamente il Sesto Dottore, ma la missione che seguì si rivelò una delle più oscure: si trovarono ad affrontare un folle tentativo di instaurare un Quarto Reich, guidato nientemeno che dal figlio segreto di Adolf Hitler. Sebbene il piano fu sventato, la vittoria ebbe un sapore amaro a causa della tragica morte della compagna Claire Aldwych ("L'Ombra nello Specchio").

Il legame con le sue radici scozzesi tornò protagonista quando decise di indagare sul mito dell'"Uomo Grigio" del Ben MacDui, responsabile di misteriose sparizioni tra gli escursionisti. Qui avvenne un incontro casuale con il Settimo Dottore e Ace. Nonostante la minaccia si rivelasse essere costituita da esseri di un universo alternativo — una situazione che il Brigadiere ritenne gestibile dalla UNIT senza ulteriore aiuto esterno — l'incontro si concluse in modo insolitamente caloroso, con l'invito rivolto al Dottore e ad Ace a trascorrere il Natale insieme a lui e sua moglie Doris ("L'Uomo Grigio della Montagna").

Le sue competenze diplomatiche e la sua esperienza nella creazione del Parlamento scozzese lo portarono poi in America, nello stato di Malebolgia. Sotto la copertura di un incarico amministrativo, il Brigadiere indagò sull'evangelista Brigham Elisha Dashwood. In un manicomio gestito da quest'ultimo, Alistair ritrovò un Ottavo Dottore in preda all'amnesia e con la personalità frammentata. Nonostante la confusione e le trame di un moderno Club del Fuoco Infernale che mirava a scatenare l'inferno sulla Terra usando la compagna Charley Pollard, il Brigadiere fu essenziale nel proteggere il Dottore finché questi non recuperò i propri ricordi, smascherando Dashwood in diretta televisiva ("Minuet in Hell").

Infine, la reputazione del Brigadiere raggiunse persino le stelle. Quando un gruppo di soldati alieni arrivò sulla Terra cercando il condottiero perfetto per le proprie guerre, usarono la conoscenza del Decimo Dottore per identificare Lethbridge-Stewart come "il più grande soldato del pianeta". Nonostante l'offerta di guidare eserciti interstellari, il Brigadiere rifiutò con la consueta umiltà e fermezza, preferendo aiutare il Dottore a distruggere la tecnologia di clonazione che alimentava quel conflitto infinito ("La Corona del Warkeeper").

Tuttavia, questo dono si rivelò presto amaro. La tragedia colpì la sua vita privata quando l'amata moglie Doris morì in un tragico incidente in barca. Consumato dal dolore e da una profonda crisi personale, il Brigadiere finì trascinato insieme all'Ottavo Dottore, Fitz e Compassion nel magico e tormentato mondo di Avalon. Inizialmente rimase distante dal Dottore, nascondendogli persino il lutto per Doris, mentre agenti dei Signori del Tempo manipolavano una guerra tra umani e Siluriani per forzare l'evoluzione di Compassion in un TARDIS vivente ("The Shadows of Avalon").

Fu proprio nel cuore di quel conflitto che il Brigadiere raggiunse la sua più grande consapevolezza filosofica. Comprese che la bellezza della vita risiede proprio nella sua transitorietà; anche se avesse potuto mantenere Doris in vita per sempre attraverso mezzi artificiali, quel legame non sarebbe stato reale. Accettò che per custodire davvero i momenti felici del passato, occorreva accettare che nulla dura in eterno. Al termine della crisi, mentre il Dottore ripartiva tra le stelle, il Brigadiere scelse di restare ad Avalon accanto alla Regina Mab, con la quale aveva sviluppato un legame profondo. Nonostante questa parentesi in un'altra dimensione, il destino lo riportò infine sulla sua amata Terra. Fu qui che, nel 2050, Alistair Gordon Lethbridge-Stewart chiuse definitivamente gli occhi per vecchiaia, lasciando un'eredità di coraggio e saggezza che sarebbe sopravvissuta per secoli ("The King of Terror").

Nonostante l'avanzare dell'età, il Brigadiere è rimasto un pilastro della UNIT, come confermato dai riferimenti in "The Sontaran Stratagem" e "Death of the Doctor", dove veniva descritto come ancora attivo e influente. La sua ultima grande missione "sul campo" lo ha visto correre in aiuto della sua cara amica Sarah Jane Smith. In "Enemy of the Bane", Alistair ha usato tutto il suo prestigio per aiutare Sarah a infiltrarsi nell'Archivio Nero della UNIT. L'obiettivo era recuperare un antico manufatto per salvare Luke, il figlio di Sarah, rapito dai Bane, evitando al contempo i canali ufficiali che avrebbero messo in pericolo il segreto sulle origini genetiche del ragazzo.

In questa occasione, il Brigadiere ha dimostrato che lo spirito del guerriero non invecchia mai. Con un gesto di pura classe e prontezza, ha abbattuto un Bane travestito da soldato utilizzando una pistola sapientemente occultata nel suo bastone da passeggio. Durante l'azione, non ha risparmiato critiche ai nuovi metodi della UNIT, esprimendo un netto disprezzo per come l'organizzazione si era evoluta rispetto ai suoi tempi, confermando la sua natura di soldato di altri tempi, legato a un codice d'onore e a un'efficacia che le nuove leve potevano solo sognare.

Il racconto delle infermiere aggiunse un tocco di profonda commozione al lutto: il Brigadiere non aveva mai smesso di aspettarlo, parlando sempre con immenso affetto del suo "Dottore" e chiedendo che venisse preparato ogni sera un secondo bicchiere di brandy accanto al suo, nel caso l'amico avesse deciso di palesarsi all'improvviso. Questa rivelazione colpì duramente il Dottore, costringendolo a confrontarsi con la crudeltà del tempo che scorre inesorabile per i suoi amici umani, lasciandolo solo con il rimpianto di non essere arrivato in tempo per quell'ultimo brindisi.

Tuttavia, il legame tra queste due leggende era così forte da trascendere la linearità temporale. Al funerale del Brigadiere si verificò un evento unico: tra la folla di volti familiari come Liz Shaw, Jo Grant, il sergente Benton e Mike Yates, erano presenti diverse incarnazioni del Dottore. La seconda, la terza, la sesta, la settima e la nona versione del Signore del Tempo si riunirono silenziosamente per rendere omaggio all'uomo che era stato il loro alleato più fedele, trasformando l'addio in una celebrazione eterna dell'amicizia che aveva salvato la Terra innumerevoli volte.

In un momento di estremo eroismo, il Brigadiere volò in soccorso di sua figlia Kate Stewart, salvandola da una caduta mortale da un aereo della UNIT. Mentre l'esercito dei Cybermen si autodistruggeva seguendo l'ordine di Danny Pink, il Brigadiere scelse di restare per compiere un ultimo, protettivo dovere verso il suo vecchio amico. Fu lui a sparare al Maestro, eliminando la minaccia e risparmiando al Dottore e a Clara il peso morale di dover compiere quel gesto.

Il Dodicesimo Dottore, comprendendo finalmente chi si celasse dietro quella corazza d'acciaio, riconobbe che il Brigadiere non avrebbe mai permesso a nessuno di stargli accanto nel momento più buio se non a lui stesso. Davanti a quel Cyberman solitario, il Dottore si irrigidì in un attenti perfetto e gli rivolse il saluto militare ufficiale: un riconoscimento di parità e rispetto che il Brigadiere aveva atteso per decenni. Con un cenno del capo, Alistair Gordon Lethbridge-Stewart volò via per l'ultima volta, concludendo la sua leggendaria carriera di difensore della Terra.

Il rispetto reciproco tra i due è stato immediato: Kate ha visto nel Dottore la leggenda dei racconti d'infanzia, mentre il Dottore ha riconosciuto in lei la stessa eccezionale tempra del Brigadiere. Questa sinergia è stata fondamentale in momenti storici, come la negoziazione del trattato di pace tra umani e Zygon — che ha visto Kate collaborare con tre diverse incarnazioni del Signore del Tempo — o la nomina del Dottore a Presidente della Terra per contrastare l'esercito di Cybermen creato da Missy. Attraverso Kate, i valori di protezione e integrità del Brigadiere continuano a vivere, garantendo che la Terra abbia sempre una difesa guidata dalla ragione e dalla scienza.

Parallelamente, il destino ha voluto che il Dottore incontrasse le radici stesse di questa famiglia leggendaria. Durante il suo ultimo viaggio, il Dodicesimo Dottore si è ritrovato accanto al Primo Dottore e a un ufficiale della Grande Guerra, il capitano Archibald Hamish Lethbridge-Stewart. In un momento di pura grazia narrativa, Archibald ha accettato con dignità il proprio destino, ignaro di essere il nonno del futuro Brigadiere. Tuttavia, il Dodicesimo Dottore, mosso da un ultimo atto di amore verso la famiglia che tanto gli aveva dato, ha manipolato il tempo per riportare il capitano nella sua trincea nel momento esatto della tregua di Natale del 1914.

Questo intervento non ha solo salvato la vita di Archibald, ma ha idealmente chiuso un cerchio perfetto: il Dottore ha protetto l'antenato dell'uomo che, per secoli, avrebbe protetto lui e l'intero pianeta. Che si tratti del coraggio di Archibald tra i ghiacci delle Fiandre o della guida illuminata di Kate nella Londra moderna, la stirpe dei Lethbridge-Stewart rimane l'alleata più preziosa e costante nella storia del Signore del Tempo.

Questa importanza è stata confermata in modi straordinari anche dalla stessa TARDIS. Durante la crisi di "Zagreus", quando la nave dovette generare un avatar olografico per comunicare con l'Ottavo Dottore e Charley Pollard, scelse proprio le sembianze del Brigadiere. Nonostante la TARDIS fosse in quel momento corrotta dalle energie dell'anti-tempo, la scelta di quella specifica forma fisica dimostra quanto l'essenza di Lethbridge-Stewart fosse impressa nel cuore della macchina del tempo: per la TARDIS, il Brigadiere rappresentava l'autorità benevola e la stabilità necessaria per guidare il Dottore fuori dal caos.

L'ammirazione del Dottore per il suo amico emergeva anche nei momenti più ironici e inaspettati. Quando l'Undicesimo Dottore ebbe bisogno di infiltrarsi in un'operazione militare statunitense nel 1963, il suo istinto lo portò immediatamente a impersonare il suo vecchio commilitone. Con un'uniforme e un paio di baffi finti, cercò di passare per il colonnello Lethbridge-Stewart; e sebbene il piano sia fallito perché il vero Alistair si trovava impegnato in manovre a Salisbury Plains, il gesto rimane un tributo toccante: per il Dottore, il Brigadiere è l'archetipo del soldato ideale, l'unico volto in cui si sente a proprio agio quando deve interpretare il ruolo del comando.